Seor Tucn, een meestersuperspion, heeft een speciale missie voor superspionnen Dora en Boots: Race naar Tico's werkplaats om hem te waarschuwen voor Swiper's plan om zijn nieuwe raketauto te stelen. In dit gevaarlijke avontuur hebben Dora en Boots hulp nodig van hun vrienden, Backpack en Map, en jou.
Om ze te helpen, moet je spionagetassen vinden die speciale spionagegadgets bevatten, zoals spionageglazen, raketsneakers, een touwwerper en meer. Je hebt deze items nodig om levels te verkennen, variërend van een regenwoud en een tuin tot een woestijn en een grot.