Toukiden Kiwami speelt zich 3 maanden na de gebeurtenissen uit het eerste deel af. Het dorp van Utakata is vreedzaam, maar het gevaar kijkt altijd om de hoek. En dat blijkt, de vrede word abrupt verstoord. Een tot nu toe onbekende Oni komt uit het noorden en verpulverd de verdedigingen van de Midlands.