Twee jaar geleden, op Leafmore High, werd een groep jonge tieners opgesloten in hun school en opgejaagd door monsters. Deze waren vrijgelaten door hun gestoorde directeur.
Enkele tieners hebben de verschrikkelijke nacht overleefd, terwijl anderen zijn omgekomen. Diegenen die het hebben overleefd hebben hun normale levens weer opgepakt en zijn gaan studeren.
In Xyanide: Resurrection speel je als Drake. Tijdens je laatste missie moest je de slechte heks Aguira naar de plaats brengen waar ze zou worden geëxecuteerd. Dit verliep echter niet volgens plan en Aguira, die hele planeten en beschavingen heeft vernietigd, ontsnapt. Je bevindt je nu in een vreemde wereld waar de wetten van de fysica niet gelden. Je bent in een wereld die Aguira met behulp van de krachtige Xyanide in haar hoofd creëert.
Stap daarom in je ruimteschip en vlieg rond in een wereld die gemaakt is door je grootste vijand. Alles wat je tegenkomt is vijandig en alleen met snelle reflexen kun je de golven vijanden ontwijken. Ontwijken is echter niet genoeg, ook zul je je vijanden moeten neerschieten. Een vernietigde vijand laat namelijk Xyanide achter en je zult dit moeten verzamelen om uit de wereld van Aguira te ontsnappen.